L'assetto dell'Agenzia è stato rivisto dalla legge finanziaria regionale 2011 che ne ha ridefinito l'organizzazione. Il nuovo assetto è vigente dal 27 luglio 2011.
Organigramma
Assetto istituzionale
Sono organi dell'Agenzia regionale di sanità: il Comitato di indirizzo e controllo, il direttore e il Collegio dei revisori dei conti.
Assetto organizzativo
L'attuale assetto organizzativo dell'Agenzia risulta articolato in: Osservatorio di epidemiologia, Osservatorio per la qualità e l'equità, Direzione.
